genefu

DOI:10.18129 / B9.bioc.genefu

乳腺癌基因表达特征的计算

Bioconductor版本:Release (3.6)

描述:这个包包含执行基因表达分析通常需要的各种任务的功能，特别是在乳腺癌研究中:不同微阵列平台之间的基因定位，分子亚型识别，发布的基因签名的实现，基因选择和生存分析。

作者:Deena M.A. Gendoo, Natchar Ratanasirigulchai, Markus S. Schroder, Laia Pare, Joel S. Parker, Aleix Prat和Benjamin Haibe-Kains

维护者:Benjamin Haibe-Kains < Benjamin .haibe。在utoronto实物地租。ca>， Markus Schroeder < Markus。施罗德在ucdconnect.ie >

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("genefu")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“genefu”)

PDF	R脚本	简介(HowTo)
PDF		参考手册
文本		自述

细节

biocViews	分类，聚类，DifferentialExpression，GeneExpression，软件，可视化
版本	2.11.2
Bioconductor自	BioC 2.8 (R-2.13)(7年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	survcomp，mclust，limma，biomaRt，iC10，目标， r (>= 2.10)
进口	北极监测和评估方案
链接
建议	GeneMeta，breastCancerVDX，breastCancerMAINZ，breastCancerTRANSBIG，breastCancerUPP，breastCancerUNT，breastCancerNKI，rmeta，Biobase，xtable，knitr，脱字符号，生存
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.pmgenomics.ca/bhklab/software/genefu
取决于我	pbcmc
进口我	consensusOV
建议我	breastCancerMAINZ，breastCancerNKI，breastCancerTRANSBIG，breastCancerUNT，breastCancerUPP，breastCancerVDX
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	genefu_2.11.2.tar.gz
Windows二进制	genefu_2.11.2.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	genefu_2.11.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genefu
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/genefu/
包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档