girafe
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doi：10.18129/b9.bioc.girafe
基因组间隔和读取功能探索的比对
生物导体版本：版本（3.6）
软件包“ Girafe”处理了下一代测序数据的对齐读取的基因组级表示。它包含一个对象类，以启用具有对齐读取和功能的基因组间隔的详细描述，可与此类间隔和对齐的读取进行比较，可视化，导出和工作。因此，软件包与shortread，iranges和GenomeIntervals的软件包之间的链接进行交互并提供了链接。
作者：乔恩·托德林（Joern Toedling
维护者：J。Toedling
引用（从r内，输入引用（“ girafe”））：
安装
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##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”）bioclite（“ girafe”）
文档
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Browsevignettes（“ Girafe”）
| R脚本 | 基因组间隔和读取功能探索的比对 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.30.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.6（R-2.11）（8年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 2.10.0），方法，生物基因（> = 0.13.8），S4VECTORS（> = 0.7.21），rsamtools，，，，间隔（> = 0.13.1），Shortread（> = 1.3.21），基因组合（> = 1.25.1），网格 |
| 进口 | 方法，生物酶，，，，生物弦，图形，grdevices，统计，utils，iranges（> = 2.3.23） |
| 链接 | |
| 建议 | 大量的，，，，org.mm.eg.db，，，，rcolorbrewer |
| 系统要求 | |
| 增强 | 基因组合 |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | girafe_1.30.0.tar.gz |
| Windows二进制 | girafe_1.30.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | girafe_1.30.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/girafe |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/girafe/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
