groHMM

DOI:10.18129 / B9.bioc.groHMM

GRO-seq分析管道

Bioconductor版本:Release (3.6)

用于分析GRO-seq数据的管道。

作者:Charles G. Danko, Minho Chae, Andre Martins, W. Lee Kraus

维护者:Anusha Nagari < Anusha。nagari at utsouthwest n.edu>， Tulip Nandu <郁金香。W. Lee Kraus < Lee . Kraus at utsouthwest n.edu>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“groHMM”)

文档

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browseVignettes(“groHMM”)

PDF	R脚本	groHMM教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	测序，软件
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.0.2)，质量平行,S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges(> = 2.5.27),GenomeInfoDb，GenomicRanges(> = 1.23.16),GenomicAlignments，rtracklayer
进口
链接
建议	BiocStyle，GenomicFeatures，刨边机，org.Hs.eg.db，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/Kraus-Lab/groHMM
BugReports	https://github.com/Kraus-Lab/groHMM/issues
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	groHMM_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	groHMM_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	groHMM_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/groHMM
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/groHMM/
软件包下载报告	下载数据