理想的

DOI:10.18129 / B9.bioc.ideal

交互式差异表达分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

该软件包提供了rna测序数据集的交互式差异表达分析功能，以快速有效地提取下游差异表达步骤的信息。Shiny应用程序封装了整个包。

作者:费德里科·马里尼[aut, cre]

维护人员:Federico Marini

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“理想”)

文档

超文本标记语言	R脚本	理想用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression，GUI，GeneExpression，GeneSetEnrichment，质量控制，RNASeq，ReportWriting，测序，软件，可视化
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(1年)
许可证	MIT +文件许可
取决于	topGO
进口	DESeq2，SummarizedExperiment，GenomicRanges，IRanges，S4Vectors，ggplot2(> = 2.0.0),d3heatmap，pheatmap，pcaExplorer，IHW，gplots，UpSetR，goseq，stringr，plyr，dplyr，limma，GOstats，GO.db，AnnotationDbi，闪亮的(> = 0.12.0),shinydashboard，shinyBS，DT，rentrez，rintrojs，knitr，rmarkdown，shinyAce，BiocParallel， grDevices, methods
链接
建议	testthat，BiocStyle，气道，org.Hs.eg.db，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene，反编排，刨边机
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/federicomarini/ideal
BugReports	https://github.com/federicomarini/ideal/issues
这取决于我
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包档案

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源包	ideal_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	ideal_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ideal_1.2.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ideal
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ideal/
软件包下载报告	下载数据