isomiRs

DOI:10.18129 / B9.bioc.isomiRs

从小RNA-seq分析isomir和mirna

Bioconductor版本:Release (3.6)

mirna和isomir的特征、聚类和差异表达。

作者:Lorena Pantano [aut, cre]， Georgia Escaramis [aut]， Christos Argyropoulos [aut]

维护者:Lorena Pantano < Lorena。潘塔诺在gmail.com>

安装

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PDF	R脚本	isomiRs
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	聚类，DifferentialExpression，RNASeq，软件，microrna的
版本	1.6.0
在Bioconductor中	BioC 3.3 (R-3.3)(2年)
许可证	MIT +文件许可
取决于	R (>= 3.4)，DiscriMiner，SummarizedExperiment，三甲(> = 1.7.6),RcppEigen
进口	BiocGenerics(> = 0.7.5),IRanges，S4Vectors，GenomicRanges，Biobase，DESeq2，重塑，tidyr，readr，dplyr，RColorBrewer，gplots、方法、ggplot2，gtools，gridExtra，网格，grDevices，图形，统计，GGally，gamlss，lme4，gamlss.dist
链接	三甲，RcppEigen
建议	knitr，RUnit，org.Mm.eg.db，集群，clusterProfiler，pheatmap，BiocStyle，testthat
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包档案

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源包	isomiRs_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	isomiRs_1.6.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	isomiRs_1.6.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/isomiRs
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/isomiRs/
软件包下载报告	下载数据