motifStack

DOI:10.18129 / B9.bioc.motifStack

为单个或多个DNA, RNA和氨基酸序列绘制堆叠标志

Bioconductor版本:Release (3.6)

motifStack包用于图形化表示具有不同相似度的多个图案。它适用于DNA/RNA序列基序和氨基酸序列基序。此外，它还为用户提供了自定义图形参数(如字体类型和符号颜色)的灵活性。

作者:欧建宏，Michael Brodsky, scott Wolfe, Lihua Julie Zhu

维护者:欧建宏<建宏。请登录umassmed.edu b>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("motifStack")

文档

超文本标记语言	R脚本	motifStack装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，ChIPSeq，ChIPchip，DataImport，微阵列，MotifAnnotation，SequenceMatching，测序，软件，可视化
版本	1.22.4
在Bioconductor中	BioC 2.11 (R-2.15)(5.5岁)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.15.1)，grImport、网格MotIV，ade4，Biostrings
进口	XML，尺度，htmlwidgets、grDevices、stats、utils
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，MotifDb，RColorBrewer，BiocStyle，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我	dagLogo
进口我	ATACseqQC，LowMACA，motifbreakR
建议我	ChIPpeakAnno
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	motifStack_1.22.4.tar.gz
Windows二进制	motifStack_1.22.4.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	motifStack_1.22.4.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/motifStack
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/motifStack/
软件包下载报告	下载数据
bioc3.6的旧源包	源存档