多检验

doi:10.18129/b9.bioc.multtest

基于重采样的多个假设检验

生物导体版本:版本(3.6)

非参数引导程序和置换基于重新采样的多个测试程序(包括经验贝叶斯方法),用于控制家庭错误率(FWER),概括性家庭错误率(GFWER),误差(TPPFP的比例)(TPPFP的比例))和错误的发现率(FDR)。实现了基于自举的无效分布的几种选择(中心,居中和缩放,分位数转换)。提供单步和阶梯方法。包括基于多种T和F统计量的测试(包括基于线性和生存模型的回归参数以及基于相关参数的T统计量)。当用T统计数据探测假设时,用户还可以选择一个潜在的更快的无效分布,该分布是多变量正常的,平均零和差异协方差矩阵源自矢量影响函数。结果是根据调整后的P值,置信区和测试统计截止的报告。该过程直接适用于在DNA微阵列实验中鉴定差异表达的基因。

作者:Katherine S. Pollard,休斯顿N. Gilbert,Yongchao GE,Sandra Taylor,Sandrine Dudoit

维护者:Katherine S. Pollard

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细节

生物浏览 差异性,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,软件
版本 2.34.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 13年)
执照 LGPL
要看 R(> = 2.10),方法,生物基因,,,,生物酶
进口 生存,,,,大量的,Stats4
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进口我 Abarray,,,,ACGH,,,,adsplit,,,,ALDEX2,,,,Anota,,,,anota2seq,,,,Chippeakanno,,,,基因主管,,,,异种态,,,,MAPKL,,,,化合物,,,,nethet,,,,Ocplus,,,,门索,,,,redseq,,,,rtopper,,,,突触,,,,Webbioc,,,,XCMS
建议我 安菲,,,,生物探测,,,,Ecolitk,,,,事实设计,,,,基因主管,,,,ggtools,,,,gostats,,,,gqtlstats,,,,gsealm,,,,迈格巴克,,,,mmpalatemirna,,,,Onechannelgui,,,,PCOT2,,,,ropls,,,,topgo
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源包 MULTTEST_2.34.0.TAR.GZ
Windows二进制 multtest_2.34.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) MULTTEST_2.34.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multtest
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/multtest/
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