nucleoSim

DOI:10.18129 / B9.bioc.nucleoSim

生成合成核小体映射

Bioconductor版本:Release (3.6)

该包可以生成覆盖核小体区域的读取的合成图谱，以及模拟下一代测序的正向和反向读取的合成图谱。用户可以在三种不同的读取定位分布中进行选择:Normal、Student和Uniform。

作者:Rawane Samb [aut]， Astrid Deschênes [cre, aut]， Pascal Belleau [aut]， Arnaud Droit [aut]

维护者:Astrid Deschenes

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“nucleoSim”)

文档

超文本标记语言	R脚本	生成合成核小体映射
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，遗传学，测序，软件，StatisticalMethod
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	统计数据,IRanges，S4Vectors、图形、方法
链接
建议	BiocStyle，BiocGenerics，knitr，rmarkdown，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/arnauddroitlab/nucleoSim
BugReports	https://github.com/arnauddroitlab/nucleoSim/issues
全靠我
进口我
建议我	RJMCMCNucleosomes
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	nucleoSim_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	nucleoSim_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	nucleoSim_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nucleoSim
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/nucleoSim/
软件包下载报告	下载数据