oneSENSE

DOI:10.18129 / B9.bioc.oneSENSE

基于非线性随机嵌入(OneSENSE)的一维单点表达式

Bioconductor版本:Release (3.6)

一个图形用户界面，便于基于t分布随机邻居嵌入(t-SNE)算法的降维方法，用于大规模细胞术数据的分类分析。使用one - sense，测量的参数被分组到预定义的类别中，每个类别的单元格被投影到一个由一维组成的空间上。每个维度都是信息丰富的，并且可以通过使用与每个轴平行对齐的热图进行注释，从而允许在二维图上同时可视化两个类别。结果图的细胞占用允许直接评估类别之间的关系。

作者:杨程，Evan Newell, Yong Kee Tan

维护者:Yong Kee Tan

安装

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文档

超文本标记语言	R脚本	介绍oneSENSE GUI
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DimensionReduction,FlowCytometry,GUI,软件
版本	1.0.0
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (>= 3.4)，webshot,闪亮的,shinyFiles,scatterplot3d
进口	Rtsne,情节,gplots， grDevices，图形，统计，utils，方法，flowCore
链接
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	oneSENSE_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	oneSENSE_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	oneSENSE_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/oneSENSE
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/oneSENSE/
软件包下载报告	下载数据