proloc

doi:10.18129/b9.bioc.proloc

空间蛋白质组学的统一生物信息学框架

生物导体版本:版本(3.6)

ProLOC软件包实现了机器学习和可视化方法,用于分析和相互作用定量质谱数据,以可靠地推断蛋白质亚细胞定位。

作者:劳伦特·加托(Laurent Gatto)和丽莎·布雷克尔(Lisa M.

维护者:laurent Gatto

引用(从r内,输入引用(“ Proloc”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ proloc”)

文档

html R脚本 空间蛋白质组学的转移学习算法
html R脚本 注释空间蛋白质组学数据
html R脚本 Proloc可用的机器学习技术
html R脚本 使用ProLOC进行空间蛋白质组学数据分析
PDF 参考手册
文本 消息
视频 proloc,prolocdata和prolocgui

细节

生物浏览 分类,,,,聚类,,,,质谱,,,,蛋白质组学,,,,QualityControl,,,,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(5年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 2.15),MSNBase(> = 1.19.20),mlinterfaces(> = 1.37.1),方法,RCPP(> = 0.10.3),生物比较
进口 生物酶,,,,mclust(> = 4.3),商在,,,,E1071,,,,采样,,,,班级,,,,克恩拉布,,,,RTSNE(> = 0.13),格子,,,,nnet,,,,Randomforest,,,,代理人,,,,fnn,,,,Hexbin,,,,生物基因,统计Dendextend,,,,rcolorbrewer,,,,,,,,大量的,,,,尼特,,,,mvtnorm,,,,gtools,,,,plyr,,,,GGPLOT2,,,,Biomart,Utils,Grdevices,图形
链接 RCPP,,,,rcpparmadillo
建议 测试,,,,rmarkDown,,,,prolocdata(> = 1.9.4),roxygen2,,,,突触,,,,Xtable,,,,RGL,,,,生物使用(> = 2.5.19),HPAR(> = 1.15.3),dplyr,,,,go.db,,,,AnnotationDbi
系统要求
增强
URL https://github.com/lgatto/proloc
BugReports https://github.com/lgatto/proloc/issues
取决于我 Prolocgui
进口我
建议我 MSNBase,,,,prolocdata,,,,rforpoteomics
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 proloc_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 proloc_1.18.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) proloc_1.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proloc
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/proloc/
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