生物导体版本:版本(3.6)
ProLOC软件包实现了机器学习和可视化方法,用于分析和相互作用定量质谱数据,以可靠地推断蛋白质亚细胞定位。
作者:劳伦特·加托(Laurent Gatto)和丽莎·布雷克尔(Lisa M.
维护者:laurent Gatto
引用(从r内,输入引用(“ Proloc”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ proloc”)
html | R脚本 | 空间蛋白质组学的转移学习算法 |
html | R脚本 | 注释空间蛋白质组学数据 |
html | R脚本 | Proloc可用的机器学习技术 |
html | R脚本 | 使用ProLOC进行空间蛋白质组学数据分析 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
视频 | proloc,prolocdata和prolocgui |
生物浏览 | 分类,,,,聚类,,,,质谱,,,,蛋白质组学,,,,QualityControl,,,,软件 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(5年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | r(> = 2.15),MSNBase(> = 1.19.20),mlinterfaces(> = 1.37.1),方法,RCPP(> = 0.10.3),生物比较 |
进口 | 生物酶,,,,mclust(> = 4.3),商在,,,,E1071,,,,采样,,,,班级,,,,克恩拉布,,,,RTSNE(> = 0.13),格子,,,,nnet,,,,Randomforest,,,,代理人,,,,fnn,,,,Hexbin,,,,生物基因,统计Dendextend,,,,rcolorbrewer,,,,秤,,,,大量的,,,,尼特,,,,mvtnorm,,,,gtools,,,,plyr,,,,GGPLOT2,,,,Biomart,Utils,Grdevices,图形 |
链接 | RCPP,,,,rcpparmadillo |
建议 | 测试,,,,rmarkDown,,,,prolocdata(> = 1.9.4),roxygen2,,,,突触,,,,Xtable,,,,RGL,,,,生物使用(> = 2.5.19),HPAR(> = 1.15.3),dplyr,,,,go.db,,,,AnnotationDbi |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/lgatto/proloc |
BugReports | https://github.com/lgatto/proloc/issues |
取决于我 | Prolocgui |
进口我 | |
建议我 | MSNBase,,,,prolocdata,,,,rforpoteomics |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | proloc_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | proloc_1.18.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | proloc_1.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proloc |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/proloc/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |