PathView
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doi：10.18129/b9.bioc.pathview
用于基于途径的数据集成和可视化的工具集
生物导体版本：版本（3.6）
PathView是用于基于路径的数据集成和可视化的工具集。它绘制并呈现有关相关途径图的各种生物学数据。所有用户都需要提供其数据并指定目标途径。PathView会自动下载Pathway Graph数据，解析数据文件，将用户数据映射到路径，并使用映射数据渲染路径图。此外，PathView还与途径和基因集（富集）分析工具无缝集成，用于大规模和完全自动化的分析。
作者：Weijun Luo
维护者：weijun luo
引用（从r内，输入引用（“ PathView”））：
安装
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##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”）bioclite（“ pathview”）
文档
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browsevignettes（“ pathview”）
| R脚本 | PathView：基于路径的数据集成和可视化 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，遗传学，，，，GraphandNetwork，，，，代谢组学，，，，微阵列，，，，途径，，，，蛋白质组学，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件，，，，系统生物学，，，，可视化 |
| 版本 | 1.18.2 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.12（R-3.0）（5年） |
| 执照 | GPL（> = 3.0） |
| 要看 | r（> = 2.10），org.hs.eg.db |
| 进口 | kegggraph，，，，XML，，，，rgraphviz，，，，图形，，，，PNG，，，，AnnotationDbi，，，，keggrest，方法，utils |
| 链接 | |
| 建议 | 量规，，，，org.mm.eg.db，，，，运行，，，，生物基因 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://pathview.uncc.edu/ |
| 取决于我 | Egsea，，，，富集兄弟 |
| 进口我 | compgo，，，，碎片器，，，，tcgabiolinksgui |
| 建议我 | clusterProfiler，，，，量规，，，，Gagedata，，，，tcgabiolinks |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | pathview_1.18.2.tar.gz |
| Windows二进制 | pathView_1.18.2.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | pathview_1.18.2.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pathview |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/pathview/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
| Bioc 3.6的旧源软件包 | 来源存档 |
