Bioconductor版本:Release (3.6)
pbcmc包描述了基因表达分类器的不确定性评估,即基于排列测试的分子特征。为了实现这一目标,通过基因标记的排列获得合成模拟对象。然后,针对相应的子类型分类器对每个合成主题进行测试,以构建零分布。因此,可以为每个受试者提供分类置信度测量,以帮助医生选择治疗方法。目前,它只适用于PAM50的基因包实现,但可以很容易地扩展到其他分子特征。
作者:Cristobal Fresno, German A. Gonzalez, Andrea S. Llera和Elmer A. Fernandez
维护者:cristobalfresno
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browseVignettes(“pbcmc”)
R脚本 | 基于置换的分子类置信度 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 分类,聚类,DifferentialExpression,GeneExpression,KEGG,微阵列,MultipleComparison,归一化,OneChannel,质量控制,RNASeq,软件,TwoChannel,mRNAMicroarray |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor中 | BioC 3.3 (R-3.3)(2年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (>= 3.4),genefu |
进口 | Biobase,BiocGenerics,BiocParallel(>= 1.3.13),平行,reshape2,电网,公用事业,cowplot、方法、limma,ggplot2,gridExtra, grDevices, stats |
链接 | |
建议 | breastCancerUPP,breastCancerNKI,breastCancerVDX,breastCancerTRANSBIG,breastCancerMAINZ,breastCancerUNT |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.bdmg.com.ar/ |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | MIGSA |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | pbcmc_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | pbcmc_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | pbcmc_1.6.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pbcmc |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/pbcmc/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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