philr

DOI:10.18129 / B9.bioc.philr

宏基因组数据的基于ILR变换的系统发育划分

Bioconductor版本:Release (3.6)

PhILR是系统发育等距对数比变换的缩写。这个包提供了分析组成数据的函数(例如，表示不同变量/部分比例的数据)。具体来说，该软件包允许分析成分数据，其中各部分可以通过系统发育树进行关联(在微生物区系调查数据中很常见)，并提供从系统发育树构建的等长对数比转换，并使用加权参考测量。

作者:贾斯汀·西尔弗曼

维护者:Justin Silverman

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“philr”)

文档

超文本标记语言	R脚本	PhILR简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	宏基因组，微生物组，测序，软件
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	猿，phangorn，tidyr，ggplot2，ggtree
链接
建议	testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle，phyloseq，glmnet，dplyr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jsilve24/philr
BugReports	https://github.com/jsilve24/philr/issues
全靠我
进口我
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	philr_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	philr_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	philr_1.4.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/philr
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/philr/
软件包下载报告	下载数据