pqsfinder

DOI:10.18129 / B9.bioc.pqsfinder

潜在四重体形成序列的识别

Bioconductor版本:Release (3.6)

该软件包的主要功能是检测可能折叠成分子内g -四重体(G4)的DNA序列模式。与许多其他方法不同的是，该软件包能够检测到从包含凸起或不匹配的不完美g序列折叠的G4s序列，因此比竞争算法更敏感。

作者:Jiri Hon, Matej Lexa和Tomas Martinek

维护者:Jiri Hon < Jiri。尊敬的gmail.com>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("pqsfinder")

文档

超文本标记语言	R脚本	pqsfinder:用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GeneRegulation，MotifDiscovery，SequenceMatching，软件
版本	1.6.3
在Bioconductor中	BioC 3.3 (R-3.3)(2年)
许可证	BSD_2_clause + file LICENSE
取决于	Biostrings
进口	Rcpp(> = 0.12.3),GenomicRanges，IRanges，S4Vectors、方法
链接	Rcpp，黑洞(> = 1.62.0)
建议	BiocStyle，knitr，Gviz，rtracklayer，ggplot2，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38，testthat
SystemRequirements	GNU make, c++ 11
增强了
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进口我
建议我
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包档案

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源包	pqsfinder_1.6.3.tar.gz
Windows二进制	pqsfinder_1.6.3.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	pqsfinder_1.6.3.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pqsfinder
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/pqsfinder/
软件包下载报告	下载数据
bioc3.6的旧源包	源存档