rBiopaxParser

DOI:10.18129 / B9.bioc.rBiopaxParser

解析BioPax文件并在R中表示它们

Bioconductor版本:Release (3.6)

解析BioPAX文件并在R中表示它们，目前支持BioPAX级别2和级别3。

作者:弗兰克·克莱默

维护者:Frank Kramer

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http:// if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("rBiopaxParser")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“rBiopaxParser”)

PDF	R脚本	rBiopaxParser装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation，软件
版本	2.18.0
在Bioconductor公司	BioC 2.12 (R-3.0)(5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.0.0)，data.table
进口	XML
链接
建议	Rgraphviz，RCurl，图，RUnit，BiocGenerics，nem，RBGL，igraph
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/frankkramer-lab/rBiopaxParser
全靠我
进口我	AnnotationHubData，pwOmics
建议我	AnnotationHub，NetPathMiner
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	rBiopaxParser_2.18.0.tar.gz
Windows二进制	rBiopaxParser_2.18.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	rBiopaxParser_2.18.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/rBiopaxParser
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/rBiopaxParser/
软件包下载报告	下载数据