rcellminer

DOI:10.18129 / B9.bioc.rcellminer

rcellminer: NCI-60细胞系的分子特征和药物反应

Bioconductor版本:Release (3.6)

几十年来，NCI-60癌症细胞系面板一直被用作抗癌药物筛选。该小组是美国国家癌症研究所(NCI)发展治疗项目(DTP, http://dtp.nci.nih.gov/)的一部分。数千种化合物已经在NCI-60上进行了测试，这些化合物已经通过许多基因和蛋白质表达、拷贝数、突变等平台进行了广泛的表征(Reinhold等，2012)。CellMiner项目(http://discover.nci.nih.gov/ CellMiner)的目的是集成用于分析NCI-60的多个平台的数据，并提供一套强大的工具来探索NCI-60数据。

作者:Augustin Luna, Vinodh Rajapakse, fabicio Sousa

维护者:Augustin Luna ， Vinodh Rajapakse < Vinodh。rajapakse在nih.gov b>报道。Elloumi在nih.gov b>

安装

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文档

超文本标记语言	R脚本	使用rcellminer
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBasedAssays，Cheminformatics，CopyNumberVariation，GeneExpression，遗传药理学，药物基因组学，软件，SystemsBiology，可视化，aCGH，microrna的
版本	2.0.0
在Bioconductor中	BioC 3.1 (R-3.2)(3年)
许可证	LGPL-3 +文件LICENSE
取决于	R (>= 3.2)，Biobase，rcdk，指纹，rcellminerData(> = 2.0.0)
进口	stringr，gplots，ggplot2，方法，统计，utils，闪亮的
链接
建议	knitr，RColorBrewer，sqldf，BiocGenerics，testthat，BiocStyle，jsonlite，d3heatmap，glmnet，foreach，doSNOW、并行
SystemRequirements
增强了
URL	http://discover.nci.nih.gov/cellminer/
这取决于我
进口我
建议我	rcellminerData
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包档案

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源包	rcellminer_2.0.0.tar.gz
Windows二进制	rcellminer_2.0.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	rcellminer_2.0.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rcellminer
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/rcellminer/
软件包下载报告	下载数据
bioc3.6的旧源包	源存档