地区

DOI:10.18129 / B9.bioc.regioneR

基于排列测试的基因组区域关联分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

regioneR提供了一个基于可定制排列测试的统计框架，以评估基因组区域集和其他基因组特征之间的关联。

作者:Anna Diez-Villanueva ， Roberto Malinverni 和Bernat Gel

维护者:Bernat Gel

安装

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文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，CopyNumberVariation，DNASeq，遗传学，MethylSeq，软件
版本	1.10.0
在Bioconductor中	BioC 3.1 (R-3.2)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	memoise，GenomicRanges，BSgenome，rtracklayer、并行
进口	memoise，GenomicRanges，BSgenome，rtracklayer、并行、图形、统计、utils、方法、GenomeInfoDb，IRanges，S4Vectors
链接
建议	BiocStyle，knitr，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我	karyoploteR
进口我	annotatr，ChIPpeakAnno，karyoploteR
建议我
构建报告

包档案

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源包	regioneR_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	regioneR_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	regioneR_1.10.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/regioneR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/regioneR/
软件包下载报告	下载数据