rfPred

DOI:10.18129 / B9.bioc.rfPred

将rfPred功能预测分数分配给错义变体列表

Bioconductor版本:Release (3.6)

基于外部大量的数据文件，其中rfPred分数是在人类外显子组的所有基因组位置上预先计算的，该软件包给出了由染色体、位置(hg19版本)、参考核苷酸和替代核苷酸以及蛋白质的单prot标识符识别的错义变体的rfPred分数。请注意，要使用该软件包，用户必须连接到Internet或下载TabixFile和索引(大约3.3 Go)。

作者:Fabienne Jabot-Hanin, Hugo Varet, Jean-Philippe Jais

维护者:Hugo Varet

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("rfPred")

文档

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browseVignettes(“rfPred”)

PDF	R脚本	CalculatingrfPredscoreswithpackagerfPred
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，分类，软件
版本	1.16.0
在Bioconductor中	BioC 2.13 (R-3.0)(4.5年)
许可证	GPL (>=2)
取决于	Rsamtools，GenomicRanges，IRanges，data.table，方法，并行
进口
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.sbim.fr/rfPred
这取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	rfPred_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	rfPred_1.16.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	rfPred_1.16.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/rfPred
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/rfPred/
软件包下载报告	下载数据