ropls

doi：10.18129/b9.bioc.ropls

PCA，PLS（-DA）和OPLS（-DA）用于多变量分析和特征OMICS数据的特征选择

生物导体版本：版本（3.6）

带有主组件分析（PCA）和部分最小二乘（PLS）的潜在变量建模是可视化，回归，分类和特征选择的强大方法，其中变量数量超过样本数量，并且变量之间具有多重共线性。正交局部最小二乘（OPL）使变化（预测）与感兴趣因素和不相关（正交）变化的变异相关（预测）。在与PLS相似的同时，OPLS促进了解释。这些化学计量学技术的成功应用包括光谱数据，例如拉曼光谱，核磁共振（NMR），质谱法（MS）在代谢组学和蛋白质组学中，以及转录组学数据。除了得分，负载和权重图外，该软件包还提供指标和图形，以确定最佳组件数量（例如，使用R2和Q2系数），通过置换测试，检测异常值和执行特征选择，检查模型的有效性（例如，在投影或回归系数中具有可变的重要性）。可以通过workflow4metabolomics.org在线资源（基于银河系环境）上的在线资源上的用户界面访问该软件包。

作者：Etienne A. Thevenot

维护者：Etienne A. Thevenot

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文本		消息

细节

生物浏览	分类，，，，脂质组学，，，，质谱，，，，代谢组学，，，，委托人，，，，蛋白质组学，，，，回归，，，，软件，，，，转录组学
版本	1.10.0
在生物导体中	Bioc 3.2（R-3.2）（2。5年）
执照	塞西尔
要看
进口	生物酶， 方法
链接
建议	生物基因，，，，生物使用，，，，相机，，，，法阿科，，，，尼特，，，，多检验，，，，rmarkDown，，，，运行，，，，XCMS
系统要求
增强
URL	http://dx.doi.org/10.1021/acs.jproteome.5b00354
取决于我
进口我	生物签名，，，，profia，，，，RQT
建议我
构建报告

包装档案

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源包	ropls_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	ROPLS_1.10.0.ZIP
Mac OS X 10.11（El Capitan）	ropls_1.10.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ropls
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/ropls/
软件包下载报告	下载统计