sangerseqR

DOI:10.18129 / B9.bioc.sangerseqR

R中Sanger测序数据的工具

Bioconductor版本:Release (3.6)

这个包包含了几个用于分析R中桑格测序数据文件的工具,包括读取.scf和.ab1文件,进行基本调用和绘制色谱图。

作者:jonathan T. Hill, Bradley Demarest

维护者:Jonathon Hill

引文(从R内,输入引用(“sangerseqR”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“sangerseqR”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“sangerseqR”)

PDF R脚本 sangerseqR
PDF 参考手册

细节

biocViews 单核苷酸多态性测序软件可视化
版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 2.14 (R-3.1)(4年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.0.2),Biostrings
进口 方法,闪亮的
链接
建议 BiocStyleknitrRUnitBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我 CrispRVariants
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 sangerseqR_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 sangerseqR_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) sangerseqR_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sangerseqR
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/sangerseqR/
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