scDD

DOI:10.18129 / B9.bioc.scDD

单细胞RNA-seq数据的混合建模，以识别具有差异分布的基因

Bioconductor版本:Release (3.6)

这个包实现了一种方法来分析单细胞RNA- seq数据利用灵活的狄利克雷过程混合模型。具有差异表达分布的基因在两种情况下被分为几种有趣的差异模式。该包还包括用于模拟具有这些负二项分布模式的数据的函数。

作者:Keegan Korthauer

维护者:Keegan Korthauer < Keegan at jimmy.harvard.edu>

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PDF	R脚本	scDD快速入门
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文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯，聚类，DifferentialExpression，MultipleComparison，RNASeq，SingleCell，软件，可视化
版本	1.2.0
在Bioconductor中	BioC 3.5 (R-3.4)(1年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.4)
进口	字段，mclust，BiocParallel，离群值，ggplot2，EBSeq，手臂，SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，设备，图形，统计，S4Vectors，食物
链接
建议	BiocStyle，knitr，gridExtra
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/kdkorthauer/scDD
BugReports	https://github.com/kdkorthauer/scDD/issues
这取决于我
进口我
建议我	飞溅
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包档案

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源包	scDD_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	scDD_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	scDD_1.2.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/scDD
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/scDD/
软件包下载报告	下载数据