烤饼

doi:10.18129/b9.bioc.scone

归一化表达数据的单元单元概述

生物导体版本:版本(3.6)

Scone是一个R包,用于比较和对单细胞RNA-SEQ和其他高通量分析的不同归一化方案的性能进行比较和排名。

作者:Michael Cole [AUT,CRE,CPH],Davide Risso [AUT,CPH]

维护者:迈克尔·科尔(Michael Cole)

引用(从r内,输入引用(“ Scone”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ scone”)

文档

html R脚本 Scone小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,基因表达,,,,正常化,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(1年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.4),方法,总结性特征
进口 图形,统计,utils,香气,,,,生物比较,,,,班级,,,,,,,,组成,,,,diptest,,,,EDGER,,,,FPC,,,,GPLOTS,grdevices,Hexbin,,,,林玛,,,,矩阵,,,,混音工具,,,,rcolorbrewer,,,,引导,,,,RHDF5,,,,Ruvseq,,,,rarpack
链接
建议 生物使用,,,,DT,,,,GGPLOT2,,,,尼特,,,,miniui,,,,NMF,,,,情节,,,,RESHAPE2,,,,rmarkDown,,,,斯克兰,,,,scrnaseq,,,,闪亮的,,,,测试,,,,Visnetwork
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/yoseflab/scone/issues
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 scone_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 scone_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) scone_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scone
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/scone/
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