斯克兰
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doi：10.18129/b9.bioc.scran
单细胞RNA-seq数据分析的方法
生物导体版本：版本（3.6）
实施单细胞RNA-seq数据的各种低级分析。提供了用于细胞特异性偏差，细胞周期阶段分配以及检测高度可变和显着相关基因的方法。
作者：Aaron Lun [AUT，CRE]，Karsten Bach [AUT]，Jong Kyoung Kim [CTB]，Antonio Scialdone [CTB]，Laleh Haghverdi [CTB]
维护者：aaron lun
引用（从r内，输入引用（“ scran”））：
安装
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文档
| html | R脚本 | 使用SCAN对单细胞RNA-seq数据进行基本分析 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 批处理效应，，，，基因表达，，，，正常化，，，，rnaseq，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录组学，，，，可视化 |
| 版本 | 1.6.9 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（2年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.4），生物比较，，，，Singlecellexperiment |
| 进口 | 总结性特征，，，，S4VECTORS，，，，生物基因，，，，RCPP（> = 0.12.14），统计，方法，utils，图形，grdevices，矩阵，，，，评分，，，，EDGER，，，，林玛，，，，DynamiCtreCut，，，，fnn，，，，Igraph，，，，闪亮的，，，，动物园，，，，Statmod，，，，GGPLOT2，，，，DT，，，，维里迪斯 |
| 链接 | beachmat，，，，RCPP，，，，Rhdf5lib |
| 建议 | 测试，，，，生物使用，，，，尼特，，，，beachmat，，，，HDF5Array，，，，limsolve，，，，org.mm.eg.db，，，，deseq2，，，，单片，，，，RTSNE，，，，pracma，，，，生物酶，，，，irlba，，，，香气 |
| 系统要求 | C ++ 11 |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 基本，，，，SCDD |
| 建议我 | 烤饼，，，，飞溅 |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | scran_1.6.9.tar.gz |
| Windows二进制 | scran_1.6.9.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | scran_1.6.9.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scran |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/scran/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
| Bioc 3.6的旧源软件包 | 来源存档 |
