seqCAT

DOI:10.18129 / B9.bioc.seqCAT

高通量测序细胞认证工具包

Bioconductor版本:Release (3.6)

seqCAT包使用来自高通量测序技术的变体调用数据(以VCF文件的形式)来验证和验证科学研究中使用的生物样本的来源、功能和特征。

作者:Erik Fasterius [aut, cre]

维护者:Erik Fasterius

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“seqCAT”)

文档

超文本标记语言	R脚本	seqCAT:高通量测序细胞认证工具包
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文本		新闻

细节

biocViews	报道，GenomicVariation，测序，软件，VariantAnnotation
版本	1.0.0
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.4)，GenomicRanges(> = 1.26.4),VariantAnnotation(> = 1.20.3)
进口	dplyr(> = 0.5.0),GenomeInfoDb(> = 1.13.4),ggplot2(> = 2.2.1),IRanges(> = 2.8.2),lazyeval(> = 0.2.0),尺度(> = 0.4.1),S4Vectors(>= 0.12.2)，统计，SummarizedExperiment(> = 1.4.0),tidyr(>= 0.6.1)， utils
链接
建议	knitr，BiocStyle，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	seqCAT_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	seqCAT_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	seqCAT_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqCAT
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/seqCAT/
软件包下载报告	下载数据