snpstats

doi:10.18129/b9.bioc.snpstats

SNPMATRIX和XSNPMATRIX类和方法

生物导体版本:版本(3.6)

大型SNP关联研究的类和统计方法。这扩展了早期的SNPMATRIX软件包,从而允许基因型的不确定性。

作者:David Clayton

维护者:David Clayton

引用(从r内,输入引用(“ snpstats”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ snpstats”)

文档

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browsevignettes(“ snpstats”)

PDF R脚本 数据输入
PDF R脚本 FST
PDF R脚本 插补和荟萃分析
PDF R脚本 LD统计
PDF R脚本 主要组件分析
PDF snpmatrix-differences
PDF R脚本 SNPSTATS简介
PDF R脚本 TDT测试
PDF 参考手册

细节

生物浏览 遗传因素,,,,微阵列,,,,SNP,,,,软件
版本 1.28.0
在生物导体中 Bioc 2.8(R-2.13)(7年)
执照 GPL-3
依靠 r(> = 2.10.0),生存,,,,矩阵, 方法
进口 图形,grdevices,统计,utils,生物基因,,,,Zlibbioc
链接
建议 Hexbin
系统要求
增强
URL
取决于我 GGBASE,,,,ggdata
进口我 funcisnp,,,,Genegeneinter,,,,ggtools,,,,gqtlstats,,,,Gwascat,,,,ldblock,,,,一顿饭,,,,RVS,,,,Scoreinvhap
建议我 crlmm,,,,Gwastools,,,,Omicrexposom,,,,变体
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 snpstats_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 snpstats_1.28.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) SNPSTATS_1.28.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snpstats
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/snpstats/
软件包下载报告 下载统计

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  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户