topgo
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doi：10.18129/b9.bioc.topgo
基因本体论的富集分析
生物导体版本：版本（3.6）
Topgo软件包提供了用于测试GO术语的工具，同时考虑GO图的拓扑结构。可以实施和应用不同的测试统计数据和不同的方法来消除GO术语之间的局部相似性和依赖性。
作者：Adrian Alexa，Jorg Rahnenfuhrer
维护者：gmail.com上的Adrian Alexa
引用（从r内，输入引用（“ Topgo”））：
安装
要安装此软件包，请启动R并输入：
##尝试http：//如果不支持https：// URL（“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”）bioclite（“ topgo”）
文档
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Browsevignettes（“ Topgo”）
| R脚本 | topgo | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 微阵列，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 2.30.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.0（R-2.5）（11年） |
| 执照 | LGPL |
| 要看 | R（> = 2.10.0），方法，生物基因（> = 0.13.6），图形（> = 1.14.0），生物酶（> = 2.0.0），go.db（> = 2.3.0），AnnotationDbi（> = 1.7.19），Sparsem（> = 0.73） |
| 进口 | 格子，，，，矩阵，，，，DBI |
| 链接 | |
| 建议 | 全部，，，，HGU95AV2.DB，，，，HGU133A.DB，，，，GeneFilter，，，，Xtable，，，，多检验，，，，rgraphviz，，，，全球测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | BGEEDB，，，，CCTORIAL，，，，Celltree，，，，Compepitools，，，，Egsea，，，，理想的，，，，RCAS，，，，rnaither，，，，翻译 |
| 进口我 | 细胞，，，，富集兄弟，，，，戈西姆，，，，MVGST，，，，PCAEXPLORER，，，，psygenet2r，，，，Sepa，，，，转录图 |
| 建议我 | clusterProfiler，，，，fgnet，，，，Intramirexplorer，，，，mirnatap，，，，林戈 |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | topgo_2.30.1.tar.gz |
| Windows二进制 | topgo_2.30.1.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | topgo_2.30.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/topgo |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/topgo/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
| Bioc 3.6的旧源软件包 | 来源存档 |
