特雷娜

doi:10.18129/b9.bioc.trena

使用基因表达,先验,机器学习拟合转录调节网络

生物导体版本:版本(3.6)

重建转录调节网络的方法,尤其是在全基因组TF结合位点信息的物种中。

作者:seth ament

维护者:Paul Shannon

引用(从r内,输入引用(“ Trena”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ trena”)

文档

html R脚本 Trena简要介绍
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 特征提取,,,,基因表达,,,,结肠管制,,,,网络引导,,,,回归,,,,软件,,,,系统生物学,,,,转录
版本 1.0.3
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.4.0),utils,Glmnet(> = 2.0.3),主题(> = 1.19.17)
进口 rsqlite,,,,拉索夫,,,,Randomforest,,,,耀斑,,,,vbsr,,,,生物比较,,,,rpostgresql, 方法,rmysql,,,,DBI,,,,BSGENOME,,,,Stringr,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp150.grch38,,,,org.hs.eg.db,,,,生物弦,,,,基因组机,,,,Biomart,,,,AnnotationDbi
链接
建议 运行,,,,林玛,,,,plyr,,,,尼特,,,,生物基因,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 trena_1.0.3.tar.gz
Windows二进制 trena_0.99.190.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) trena_1.0.3.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trena
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/trena/
软件包下载报告 下载统计
Bioc 3.6的旧源软件包 来源存档

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户