触发

DOI:10.18129 / B9.bioc.trigger

基因表达遗传学的转录调控推论

Bioconductor版本:Release (3.6)

这个R包为整合基因组数据的统计分析提供了工具,这些数据涉及基因型、高维中间性状(例如,基因表达、蛋白质丰度)和高阶性状(表型)的一些组合。该软件包包括以下功能:(1)构建遗传标记和基因表达之间的全局链接图;(2)分析基因表达的多位点连锁(上位性);(3)量化每个位点解释的全基因组变异比例,并确定eQTL热点;(4)估计成对因果基因调控概率,构建基因调控网络;(5)确定感兴趣的数量性状的因果基因。

作者:Lin S. Chen , Dipen P. Sangurdekar 和John D. Storey

维护者:John D. Storey

引文(从R内,输入引用(“触发”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“触发器”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“触发”)

PDF R脚本 触发教程
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpressionGeneticVariability遗传学微阵列单核苷酸多态性软件
版本 1.24.0
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(6.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 2.14.0),corpcorqtl
进口 qvalue、方法、图形、股东价值分析
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 trigger_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 trigger_1.24.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) trigger_1.24.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trigger
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/trigger/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: