西瓜

DOI:10.18129 / B9.bioc.wateRmelon

Illumina 450甲基化阵列归一化和度量

Bioconductor版本:Release (3.6)

15种beta版本和3种性能指标,以及由methylumi和minfi包生成的对象的方法。

作者:Leonard C Schalkwyk, Ruth Pidsley, Chloe CY Wong,由Nizar Touleimat, Matthieu Defrance, Andrew Teschendorff, Jovana Maksimovic, Tyler Gorrie-Stone, Louis El Khoury贡献功能

维护人员:essex.ac.uk>的Leo

引用(从R中,输入引用(“西瓜”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“西瓜”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“西瓜”)

PDF R脚本 西瓜\ Rpackage{}包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DNAMethylation微阵列预处理质量控制软件TwoChannel
版本 1.22.1
Bioconductor自 BioC 2.12 (R-3.0)(5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 2.10),Biobaselimma、方法、matrixStatsmethylumi光民中华民国IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19illuminaio
进口 Biobase
链接
建议 RPMM
SystemRequirements
增强了 minfi
URL
取决于我 bigmelonskewr
进口我 冠军ENmix
建议我 RnBeads
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 wateRmelon_1.22.1.tar.gz
Windows二进制 wateRmelon_1.22.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) wateRmelon_1.22.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/wateRmelon
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/wateRmelon/
包下载报告 下载数据
BioC 3.6的旧源包 源存档

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