XCMS
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doi：10.18129/b9.bioc.xcms
LC/MS和GC/MS数据分析
生物导体版本：版本（3.6）
色谱分离和单光谱质谱数据的处理和可视化框架。从AIA/ANDI NETCDF，MZXML，MZDATA和MZML文件中导入。预处理数据，用于高通量，未定位的分析物分析。
作者：Colin A. Smith
维护者：Steffen Neumann
引用（从r内，输入引用（“ XCMS”））：
安装
要安装此软件包，请启动R并输入：
##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”）bioclite（“ xcms”）
文档
| html | R脚本 | 将FTICR-MS数据与XCMS分组 |
| html | R脚本 | LCMS数据预处理和XCMS分析 |
| html | R脚本 | XCMS中的新功能和修改的功能 |
| html | R脚本 | 使用XCMS处理串联MS和MSN数据 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 质谱，，，，代谢组学，，，，软件 |
| 版本 | 3.0.2 |
| 在生物导体中 | Bioc 1.6（R-2.1）或更早（> 13年） |
| 执照 | GPL（> = 2） +文件许可证 |
| 要看 | R（> = 2.14.0），方法，生物酶，，，，生物比较（> = 1.8.0），MSNBase（> = 2.3.11） |
| 进口 | MZR（> = 1.1.6），生物基因，，，，蛋白质，，，，格子，，，，rcolorbrewer，，，，plyr，，，，拉恩，，，，多检验，，，，MassSpececebeet（> = 1.5.2），S4VECTORS |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特（> = 1.1.0），法阿科，，，，MSDATA，，，，NCDF4，，，，RGL，，，，微实验，，，，运行，，，，潘德 |
| 系统要求 | |
| 增强 | rgraphviz，，，，rmpi，，，，XML |
| URL | http://metlin.scripps.edu/download/和https://github.com/sneumann/xcms |
| BugReports | https://github.com/sneumann/xcms/issues/new |
| 取决于我 | 相机，，，，法阿科，，，，弗拉姆，，，，IPO，，，，洛布斯塔斯，，，，变代，，，，metams，，，，profia，，，，pth2O2lipids |
| 进口我 | 相机，，，，Cosmiq，，，，梅特，，，，Risa |
| 建议我 | MassSpececebeet，，，，MSDATA，，，，M型，，，，mtbls2，，，，rforpoteomics，，，，rmassbank，，，，ropls |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | xcms_3.0.2.2.tar.gz |
| Windows二进制 | xcms_3.0.2.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | xcms_3.0.2.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/xcms |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/xcms/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
| Bioc 3.6的旧源软件包 | 来源存档 |
