纱

DOI:10.18129 / B9.bioc.yarn

YARN:鲁棒多条件RNA-Seq预处理和归一化

Bioconductor版本:Release (3.6)

使用先前开发的工具组合加速大型RNA-Seq分析。YARN的目的是让用户更容易执行基本的错误注释质量控制、过滤和感知条件的规范化。YARN利用许多Bioconductor工具和统计技术来解释在非常大的RNA-seq实验中发现的巨大异质性和稀疏性。

作者:Joseph N Paulson [aut, cre]， Cho-Yi Chen [aut]， Camila lope - ramos [aut]， Marieke Kuijjer [aut]， John Platig [aut]， Abhijeet Sonawane [aut]， Maud Fagny [aut]， Kimberly Glass [aut]， John Quackenbush [aut]

维护者:Joseph N Paulson

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PDF	R脚本	YARN:鲁棒多组织rna序列预处理和归一化
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细节

biocViews	注释，聚类，GeneExpression，归一化，预处理，质量控制，测序，软件，可视化
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase
进口	biomaRt，下载器，刨边机，gplots、图形、limma，matrixStats，preprocessCore，readr，RColorBrewer统计数据,quantro
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat(> = 0.8)
SystemRequirements
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	yarn_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	yarn_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	yarn_1.4.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/yarn
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/yarn/
软件包下载报告	下载数据