BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19

智人全基因组序列(UCSC版本hg19)

Bioconductor版本:Release (3.6)

由UCSC提供的智人(人类)全基因组序列(hg19, 2009年2月)，并存储在Biostrings对象中。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< maintainer@bioconductor.org >

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文档

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细节

biocViews	AnnotationData，BSgenome，遗传学，Homo_sapiens
版本	1.4.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.33.5)
进口	BSgenome
链接
建议	TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked，嵌合体，食典委，motifRG，tra利用
进口我	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked，ChIPComp，MADSEQ，RareVariantVis，美国广播公司，REMP，trena
建议我	AneuFinder，ArrayTV，ATACseqQC，BadRegionFinder，Basic4Cseq，BBCAnalyzer，biovizBase，ChIPpeakAnno，chromVAR，cn，CRISPRseek，customProDB，DNAshapeR，ensembldb，esATAC，FDb.FANTOM4.promoters.hg19，FDb.UCSC.snp135common.hg19，FDb.UCSC.snp137common.hg19，gcapc，GenomicAlignments，GenomicFeatures，GenomicRanges，GenomicScores，GenVisR，ggbio，gmapR，GoogleGenomics，GUIDEseq，Gviz，h5vc，InPAS，感兴趣，IsoformSwitchAnalyzeR，karyoploteR，MEDIPS，MinimumDistance，海市蜃楼，motifbreakR，motifmatchr，MutationalPatterns，oneChannelGUI，OrganismDbi，PGA，qsea，R453Plus1Toolbox，ramwas，Rariant，rGADEM，RiboProfiling，Rsamtools，RSVSim，rtracklayer，SGSeq，签名者，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP142.GRCh37，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，连接工具，VariantAnnotation，wavClusteR，XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，YAPSA

包档案

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源包	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19/
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