Bioconductor版本:Release (3.6)
从NCBI dbSNP Build 144中提取的智人SNP位点和等位基因。该包使用的源数据文件由NCBI于2015年5月30日创建,包含参考基因组GRCh38的snp。p2 (GRCh38的修补版本,不会改变染色体1-22,X, Y, MT)。注意,这些snp可以“注入”到BSgenome.Hsapiens.NCBI中。GRCh38或BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38。
作者:hervevev pag
维护者:H. pageries
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):
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##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38")
参考手册 |
biocViews | AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens,SNPlocs |
版本 | 0.99.20 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | BSgenome(> = 1.43.4) |
进口 | 方法,跑龙套,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome |
链接 | |
建议 | Biostrings,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | BSgenome,XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38 |
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源包 | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38_0.99.20.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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