RforProteomics

DOI:10.18129 / B9.bioc.RforProteomics

“使用R和Bioconductor进行蛋白质组学数据分析”出版物的配套包

Bioconductor版本:Release (3.6)

此包包含演示“使用R和Bioconductor进行蛋白质组学数据分析”论文的代码。两个小插图描述了复制论文中描述的例子和图所需的代码和数据，以及蛋白质组学可视化的功能。

作者:Laurent Gatto [aut, cre]， Thomas Lin Pedersen [ctb]， Sebastian Gibb [ctb]， Vlad Petyuk [ctb]

维护者:Laurent Gatto

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("RforProteomics")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“RforProteomics”)

PDF	R脚本	利用R和Bioconductor进行蛋白质组学数据分析的现状
PDF	R脚本	RforProteomics Bioc2013海报
PDF	R脚本	用R进行蛋白质组学数据分析
超文本标记语言		利用R和Bioconductor可视化蛋白质组学数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData，MassSpectrometryData，ReproducibleResearch
版本	1.15.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	MSnbase
进口	R.utils，Biobase，rpx，biocViews，BiocInstaller，interactiveDisplay，闪亮的
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，mzR，xcms，msdata，等压线，MALDIquant(> = 1.12),MALDIquantForeign，readBrukerFlexData，rTANDEM，synapter，synapterdata，IPPD，Rdisop，OrgMassSpecR，大脑，的方式，hpar，GO.db，org.Hs.eg.db，biomaRt，RColorBrewer，ggplot2，reshape2，xtable，晶格，mzID，pRoloc，pRolocdata，MSGFplus，MSGFgui，MSnID，msmsTests，msmsEDA，corrplot，Heatplus，gplots，维恩图，genefilter
SystemRequirements
增强了	切肉刀
URL	http://lgatto.github.com/RforProteomics/
取决于我
进口我
建议我	MSstatsQC，proteoQC，qcmetrics
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	RforProteomics_1.15.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RforProteomics
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RforProteomics/
包下载报告	下载数据