SystemPiperData

doi:10.18129/b9.bioc.systempiperdata

SystemPiperData:NGS工作流模板和示例数据

生物导体版本:版本(3.6)

SystemPiperData是一个辅助软件包,可以使用单个命令NGS Workflow模板生成,该模板旨在由其父封装Systempiper使用。后者是一个用于构建端到端分析管道的环境,其下一代序列(NGS)应用程序(例如RNA-Seq,Ribo-Seq,Chip-Seq,chip-Seq,var-Seq等)的自动报告生成。使用SystemPiperData的详细示例在SystemPiper的概述Vignette中给出。

作者:托马斯·吉尔克(Thomas Girke)

维护者:thomas girke

引用(从r内,输入引用(“ SystemPiperData”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ systempiperdata”)

文档

html R脚本 概述小插图
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文本 读书我
文本 消息

细节

生物浏览 结盟,,,,chipseq,,,,覆盖范围,,,,DataImport,,,,实验数据,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,遗传学,,,,基础设施,,,,甲基,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,SNP,,,,测序
版本 1.6.0
执照 艺术2.0
要看 方法
进口 生物基因
链接
建议 运行,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,Systempiper
系统要求
增强
URL https://github.com/tgirke/systempiperdata
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 SystemPiperData_1.6.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/systempiperdata
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/systempiperdata/
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