生物导体版本:版本(3.6)
SystemPiperData是一个辅助软件包,可以使用单个命令NGS Workflow模板生成,该模板旨在由其父封装Systempiper使用。后者是一个用于构建端到端分析管道的环境,其下一代序列(NGS)应用程序(例如RNA-Seq,Ribo-Seq,Chip-Seq,chip-Seq,var-Seq等)的自动报告生成。使用SystemPiperData的详细示例在SystemPiper的概述Vignette中给出。
作者:托马斯·吉尔克(Thomas Girke)
维护者:thomas girke
引用(从r内,输入引用(“ SystemPiperData”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ systempiperdata”)
html | R脚本 | 概述小插图 |
参考手册 | ||
文本 | 读书我 | |
文本 | 消息 |
生物浏览 | 结盟,,,,chipseq,,,,覆盖范围,,,,DataImport,,,,实验数据,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,遗传学,,,,基础设施,,,,甲基,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,SNP,,,,测序 |
版本 | 1.6.0 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 方法 |
进口 | 生物基因 |
链接 | |
建议 | 运行,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,Systempiper |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/tgirke/systempiperdata |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | SystemPiperData_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/systempiperdata |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/systempiperdata/ |
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