等位基因平衡

doi:10.18129/b9

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅等位基因平衡

研究等位基因特定表达

生物导体版本:3.7

使用RNA-seq数据为等位基因表达研究提供了一个框架。

作者:Jesper R Gadin,Lasse Folkersen

维护者:jesper r gadin

引用(从r内,输入引用(“等位基因平衡”)):

安装

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PDF R脚本 等位基因平衡小插图
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文本 消息

细节

生物浏览 遗传学,,,,基础设施,,,,测序,,,,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.2.0),网格,基因组机(> = 1.31.8),总结性特征(> = 0.2.0),基因组签名(> = 1.15.6)
进口 方法,生物基因,,,,AnnotationDbi,,,,BSGENOME(> = 1.47.3),变体(> = 1.25.11),生物弦(> = 2.47.6),S4VECTORS(> = 0.17.25),iranges(> = 2.13.12),rsamtools(> = 1.31.2),GenomicFeatures(> = 1.31.3),GVIZ,,,,格子,,,,LatticeExtra,,,,栅格,,,,seqinr,,,,GenomeInfodB,,,,nlme
链接
建议 测试,,,,org.hs.eg.db,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/pappewaio/allelicimbalance
BugReports https://github.com/pappewaio/allelicimbalance/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

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源包 Allelicimbalance_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 AlleLicimbalance_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) Allelicimbalance_1.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/allowricimbalance
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/等位基因影响
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/allelicimbalance/
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