AnnotationHubData

DOI:10.18129 / B9.bioc.AnnotationHubData

此包适用于Bioconductor的3.7版本;有关稳定的最新发布版本，请参见AnnotationHubData．

将公共数据资源转换为Bioconductor数据结构

Bioconductor版本:3.7

这些配方将种类繁多且数量不断增长的公共生物信息数据集转换为易于使用的标准Bioconductor数据结构。

作者:Martin Morgan [ctb]， Marc Carlson [ctb]， Dan Tenenbaum [ctb]， Sonali Arora [ctb]， Paul Shannon [ctb]， Bioconductor包装维护员[cre]

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("AnnotationHubData")

文档

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browseVignettes(“AnnotationHubData”)

超文本标记语言	R脚本	AnnotationHub:创建AnnotationHub包
超文本标记语言		介绍AnnotationHubData
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，软件
版本	1.10.3
Bioconductor自	BioC 3.2 (R-3.2)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.2.2)，方法，utils，S4Vectors(> = 0.7.21),IRanges(> = 2.3.23),GenomicRanges，AnnotationHub(> = 2.9.14)
进口	GenomicFeatures，Rsamtools，rtracklayer，BiocGenerics，jsonlite，BiocInstaller，biocViews，AnnotationDbi，Biobase，Biostrings，DBI，GEOquery，GenomeInfoDb(> = 1.15.4),OrganismDbi，RSQLite，rBiopaxParser，AnnotationForge，futile.logger1.3.0(> =版本),XML，RCurl
链接
建议	RUnit，knitr，BiocStyle，grasp2db，BiocInstaller
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	ExperimentHubData，ProteomicsAnnotationHubData
进口我	AHEnsDbs
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	AnnotationHubData_1.10.3.tar.gz
Windows二进制	AnnotationHubData_1.10.3.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	AnnotationHubData_1.10.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AnnotationHubData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AnnotationHubData
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/AnnotationHubData/
包下载报告	下载数据