催化剂
doi：10.18129/b9.bioc.catalyst
该包适用于生物导体的3.7版；对于稳定的最新版本，请参阅催化剂。
细胞仪数据分析工具
生物导体版本：3.7
质量细胞仪（CYTOF）使用重金属同位素而不是荧光标签作为记者标记抗体，从而大大降低了光谱重叠，并允许检查单个细胞水平的50多个参数。虽然在细胞术中，光谱重叠在细胞仪中的明显明显不高，但由于检测敏感性，同位素杂质而引起的溢出，氧化物的形成会阻碍数据的可解释性。我们设计了催化剂（细胞术数据分析工具），以提供用于预处理细胞术数据的管道，包括i）使用珠标准标准，ii）单细胞反卷积和iii）基于珠的补偿。
作者：Helena L. Crowell [Cre]，Vito R.T.Zanotelli [AUT]，StéphaneChevrier[AUT，DTC]，Mark D. Robinson [Aut，FND]，Bernd Bodenmiller [FND]
维护者：Helena L. Crowell
引用（从r内，输入引用（“催化剂”））：
安装
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文档
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Browsevignettes（“催化剂”）
| html | R脚本 | 用催化剂差分分析 |
| html | R脚本 | 用催化剂进行预处理 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 质谱，，，，正常化，，，，预处理，，，，Singlecell，，，，软件，，，，统计信息 |
| 版本 | 1.4.2 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.5（R-3.4）（1。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | R（> = 3.4） |
| 进口 | 生物酶，，，，循环，，，，复杂的图像，，，，共识ClusterPlus，，，，dplyr，，，，刚果，，，，DT，，，，流核，，，，流动，，，，GGPLOT2，，，，Ggrepel，图形，grdevices，网格，栅格，，，，htmltools，，，，林玛，，，，马格里特，，，，矩阵， 方法，nnls，，，，情节，，，，rcolorbrewer，，，，RESHAPE2，，，，RTSNE，，，，S4VECTORS，，，，秤，，，，闪亮的，，，，发光的dashboard，，，，Shinyjs，，，，丝绸，统计总结性特征，，，，花花公子，UTILS |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，diffcyt |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/helenalc/catalyst |
| BugReports | https://github.com/helenalc/catalyst/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | diffcyt |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | catalyst_1.4.2.tar.gz |
| Windows二进制 | catalyst_1.4.2.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | catalyst_1.4.2.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/catalyst |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/催化剂 |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/catalyst/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
