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别致的
DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIC
这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅别致的。
质量控制管道ChIP-Seq数据
Bioconductor版本:3.7
质量控制管道ChIP-seq数据使用一组全面的质量控制指标,包括此前提出的指标以及小说的,基于局部特征的浓缩。样本的框架允许评估质量与尖锐或广泛的浓缩,而此前提出的指标没有考虑这些。别致的提供了一个参考纲要质量控制指标和训练有素的得分机器学习模型样本。
作者:卡门·玛丽亚Livi
维护人员:卡门·玛丽亚Livi <卡门。在ifom.eu livi >
从内部引用(R,回车引用(“时髦”)):
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| R脚本 | 别致的 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | ChIPSeq,质量控制,软件 |
| 版本 | 1.0.0 |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | 仕达屋优先计划R (> = 3.5) |
| 进口 | ChIC.data(> = 0.99),caTools、方法、GenomicRanges,IRanges平行,脱字符号,统计grDevices跑龙套、图形S4Vectors,BiocGenerics |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ChIC_1.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | ChIC_1.0.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIC |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/别致 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/ChIC/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
