Chippeakanno
doi：10.18129/b9.bioc.chippeakanno
该包适用于生物导体的3.7版；对于稳定的最新版本，请参阅Chippeakanno。
从CHIP-SEQ，芯片芯片实验或任何实验中鉴定出的峰的批次注释导致大量染色体范围
生物导体版本：3.7
该软件包包括以检索峰周围序列，获得富集基因本体（GO）术语，找到最近的基因，外显子，miRNA或自定义特征（例如大多数保守元素以及用户提供的其他转录因子结合位点）的功能。从2.0.5开始，已经添加了新功能，以查找具有摘要统计数据（峰值nearbdp）的双向启动子的峰值，以汇总峰（SummarizepatterninInpeaks）中的基序的发生，并将其他IDS添加到带注释的峰或富集的峰（Addgeneids）（）。该软件包利用BiomArt，Iranges，BioStrings，BSGENOME，GO.DB，MULTETEST和STAT软件包。
作者：Lihua Julie Zhu，Jianhong OU，Jun Yu，HervéPagès，Claude Gazin，Nathan Lawson，Ryan Thompson，Simon Lin，David Lapointe和Michael Green
维护者：lihua julie zhu
引用（从r内，输入引用（“ Chippeakanno”））：
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| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 注解，，，，chipseq，，，，芯片，，，，软件 |
| 版本 | 3.14.2 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.5（R-2.10）（9年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | R（> = 3.2），方法，网格，iranges（> = 2.13.12），生物弦（> = 2.47.6），基因组机（> = 1.31.8），S4VECTORS（> = 0.17.25），Venndiagram |
| 进口 | 生物基因（> = 0.1.0），go.db，，，，Biomart，，，，BSGENOME，，，，GenomicFeatures，，，，GenomeInfodB，，，，矩阵，，，，AnnotationDbi，，，，林玛，，，，多检验，，，，rbgl，，，，图形，，，，Biocinstaller，统计区域人，，，，DBI，，，，Ensembldb，，，，生物酶，，，，seqinr，，，，IDR，，，，基因组签名，，，，延迟，，，，总结性特征，，，，rsamtools |
| 链接 | |
| 建议 | Reactome.db，，，，bsgenome.ecoli.ncbi.20080805，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，org.ce.eg.db，，，，org.hs.eg.db，，，，bsgenome.celegans.ucsc.ce10，，，，BSGENOME.DRERIO.UCSC.DANRER7，，，，ensdb.hsapiens.v75，，，，Ensdb.hsapiens.v79，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown，，，，GPLOTS，，，，生物使用，，，，rtracklayer，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，TrackViewer，，，，Motifstack，，，，有机体 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | chipseqdb，，，，redseq，，，，瓦肯 |
| 进口我 | atacseqqc，，，，dchiprep，，，，DESCAN2，，，，funcisnp，，，，Guideseq，，，，redseq |
| 建议我 | R3CPET，，，，Ripseeker，，，，seqsetvis |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | chippeakanno_3.14.2.tar.gz |
| Windows二进制 | chippeakanno_3.14.2.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | chippeakanno_3.14.2.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chippeakanno |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/chippeakanno |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/chippeakanno/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
