copywriter

doi:10.18129/b9.bioc.copywriter

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅copywriter

使用非目标读取的目标测序中的复制编号信息

生物导体版本:3.7

撰稿人通过取消靶向启动读数来从目标测序中提取DNA复制编号信息。它允许提取均匀分布的拷贝数信息,无需参考即可使用,并且可以应用于从包括染色质免疫沉淀和小基因面板上的各种技术获得的测序数据。因此,撰稿人构成了广泛适用于可用复制号码检测工具的替代方案。

作者:托马斯·库尔曼

维护者:托马斯·库尔曼(Thomas Kuilman)

引用(从r内,输入引用(“撰稿人”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ copywriter”)

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PDF R脚本 copywriter
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 库务,,,,覆盖范围,,,,Exomeseq,,,,预处理,,,,软件,,,,目标征服,,,,可视化
版本 2.12.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(3.5岁)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.2),生物比较
进口 矩阵,,,,gtools,,,,Data.Table,,,,S4VECTORS,,,,chipseq,,,,iranges,,,,rsamtools,,,,DNACOPIGY,,,,基因组签名,,,,基因组机,,,,CopyHelper,,,,GenomeInfodB,,,,徒劳
链接
建议 生物使用,,,,Sclcbam,,,,
系统要求
增强
URL https://github.com/peeperlab/copywriter
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 copywriter_2.12.0.tar.gz
Windows二进制 copywriter_2.12.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) Coperwriter_2.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/copywriter
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/抄写员
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/copywriter/
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