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DMRcaller
DOI:10.18129 / B9.bioc.DMRcaller
这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DMRcaller。
调用者差异甲基化区域
Bioconductor版本:3.7
使用酸性亚硫酸盐测序数据之间的两个条件,识别差异甲基化区域的条件在CG和non-CG上下文。输入是残雪报告文件由俾斯麦和dmr的输出是一个列表存储为农庄组织对象。
作者:尼古拉·拉Zabet < n.r。在gen.cam.ac.uk zabet >,Jonathan Michael Foonlan Tsang
维护人员:尼古拉·拉Zabet < n.r。在gen.cam.ac.uk zabet >
从内部引用(R,回车引用(“DMRcaller”)):
安装
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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“DMRcaller”)
文档
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| R脚本 | DMRcaller | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 报道,DNAMethylation,DifferentialMethylation,测序,软件 |
| 版本 | 1.12.7 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(3.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.5),GenomicRanges,IRanges,S4Vectors |
| 进口 | 平行,Rcpp,RcppRoll,betareggrDevices图形,方法,属性,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | DMRcaller_1.12.7.tar.gz |
| Windows二进制 | DMRcaller_1.12.7.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | DMRcaller_1.12.7.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DMRcaller |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DMRcaller |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/DMRcaller/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
