该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅dmrcate。
生物导体版本:3.7
使用整个基因组双磷酸盐测序(WGB)和Illumina Infinium阵列(450K和EPIC)数据,从人类基因组中差异甲基化区域(DMR)的从头鉴定和提取。提供了可能被SNP和跨杂交混淆的过滤探针的功能。包括Granges生成和绘图功能。
作者:蒂姆·彼得斯
维护者:蒂姆·彼得斯(Tim Peters)
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R脚本 | DMRCATE软件包用户指南 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | DNAMETHYLATY,,,,差异性,,,,差甲基化,,,,基因表达,,,,遗传学,,,,基因数,,,,甲基化array,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,Onechannel,,,,QualityControl,,,,软件,,,,时间科,,,,两通道 |
版本 | 1.16.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.14(R-3.1)(4。5年) |
执照 | 文件许可证 |
要看 | r(> = 3.3.0),Minfi,,,,DSS,,,,dmrcatedata |
进口 | 林玛,,,,甲基小姐,,,,基因组机,并行,方法,图形,plyr,,,,GVIZ,,,,iranges,统计,utils,S4VECTORS |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,运行,,,,生物基因,,,,Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19,,,,Illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b2.hg19 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | 冠军,,,,甲基化arrayAnalysy |
进口我 | 一顿饭 |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
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源包 | dmrcate_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | dmrcate_1.16.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dmrcate |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/dmrcate |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/dmrcate/ |
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