该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅液滴。
生物导体版本:3.7
从液滴技术(例如10X基因组学)中处理单细胞(RNA-SEQ)数据提供了许多实用功能。这包括数据加载,从空液滴中识别单元格,去除条形码折叠的伪细胞以及计数矩阵的下采样。
作者:Aaron Lun [AUT,CRE],Jonathan Griffiths [CTB],Davis McCarthy [CTB]
维护者:aaron lun
引用(从r内,输入引用(“液滴”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ droplettutils”)
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Browsevignettes(“液滴”)
html | R脚本 | 用于处理基于液滴的单细胞RNA-seq数据的实用程序 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 覆盖范围,,,,DataImport,,,,基因表达,,,,rnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学 |
版本 | 1.0.3 |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.5),生物比较,,,,Singlecellexperiment |
进口 | S4VECTORS,,,,矩阵,方法,utils,stats,EDGER,,,,RCPP,,,,RHDF5 |
链接 | RCPP,,,,beachmat,,,,Rhdf5lib |
建议 | 测试,,,,beachmat,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,HDF5Array |
系统要求 | C ++ 11 |
增强 | |
URL | |
取决于我 | Simplesinglecell |
进口我 | |
建议我 | 评分 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | dropletutils_1.0.3.tar.gz |
Windows二进制 | lopletutils_1.0.3.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Lopletutils_1.0.3.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dropletutils |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/滴虫 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/dropletutils/ |
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