液滴

doi:10.18129/b9.bioc.dropletutils

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅液滴

处理单细胞液滴数据的实用程序

生物导体版本:3.7

从液滴技术(例如10X基因组学)中处理单细胞(RNA-SEQ)数据提供了许多实用功能。这包括数据加载,从空液滴中识别单元格,去除条形码折叠的伪细胞以及计数矩阵的下采样。

作者:Aaron Lun [AUT,CRE],Jonathan Griffiths [CTB],Davis McCarthy [CTB]

维护者:aaron lun

引用(从r内,输入引用(“液滴”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ droplettutils”)

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html R脚本 用于处理基于液滴的单细胞RNA-seq数据的实用程序
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,DataImport,,,,基因表达,,,,rnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学
版本 1.0.3
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.5),生物比较,,,,Singlecellexperiment
进口 S4VECTORS,,,,矩阵,方法,utils,stats,EDGER,,,,RCPP,,,,RHDF5
链接 RCPP,,,,beachmat,,,,Rhdf5lib
建议 测试,,,,beachmat,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,HDF5Array
系统要求 C ++ 11
增强
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取决于我 Simplesinglecell
进口我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 dropletutils_1.0.3.tar.gz
Windows二进制 lopletutils_1.0.3.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) Lopletutils_1.0.3.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dropletutils
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/滴虫
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/dropletutils/
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