ExpressionAtlas

DOI:10.18129 / B9.bioc.ExpressionAtlas

此包适用于Bioconductor的3.7版本;有关稳定的最新发布版本，请参见ExpressionAtlas．

从EMBL-EBI表达式图集下载数据集

Bioconductor版本:3.7

此包用于查找EMBL-EBI Expression Atlas中的数据集，并下载到R中进行进一步分析。每个Expression Atlas数据集表示为一个SimpleList对象，每个平台有一个元素。测序数据包含在summarizeexperiment对象中，而微阵列数据包含在ExpressionSet或MAList对象中。

作者:玛丽亚keay

维护者:Maria Keays < Maria。在gmail.com keay >

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("ExpressionAtlas")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“ExpressionAtlas”)

超文本标记语言	R脚本	ExpressionAtlas
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ArrayExpress，ExperimentData，ExpressionData，MicroarrayData，SequencingData，软件
版本	1.8.1
Bioconductor自	BioC 3.3 (R-3.3)(2.5年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R(>= 3.2.0)，方法，Biobase，SummarizedExperiment，limma，S4Vectors，xml2
进口	跑龙套,XML，httr
链接
建议	knitr，testthat，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	π
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ExpressionAtlas_1.8.1.tar.gz
Windows二进制	ExpressionAtlas_1.8.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ExpressionAtlas_1.8.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExpressionAtlas
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ExpressionAtlas
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ExpressionAtlas/
包下载报告	下载数据