fgnet

doi:10.18129/b9.bioc.fgnet

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅fgnet

来自生物富集分析的功能基因网络

生物导体版本:3.7

从多个注释空间中的富集分析聚类中构建和可视化功能基因和项网络。该软件包包括图形用户界面(GUI)和功能,以通过David,Gen​​eterm Linker,GAGE(GSEA)和TOPGO执行功能丰富分析。

作者:Sara Aibar,Celia Fontanillo,Conrad Droste和Javier de Las Rivas。

维护者:sara aibar

引用(从r内,输入引用(“ fgnet”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ fgnet”)

文档

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browsevignettes(“ fgnet”)

html R脚本 fgnet
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,聚类,,,,功能基因组学,,,,,,,,基因烯,,,,网络,,,,NetworkEnrichment,,,,途径,,,,软件,,,,可视化
版本 3.14.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 2.15)
进口 Igraph(> = 0.6),HWRITER,,,,r.utils,,,,XML,,,,plotrix,,,,RESHAPE2,,,,rcolorbrewer,,,,PNG
链接
建议 RGTK2,,,,rcurl,,,,rdavidwebservice,,,,量规,,,,topgo,,,,keggprofile,,,,go.db,,,,kegg.db,,,,Reactome.db,,,,运行,,,,生物基因,,,,org.sc.sgd.db,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,AnnotationDbi
系统要求
增强
URL http://www.cicancer.org
取决于我
进口我 Intramirexplorer
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 fgnet_3.14.0.tar.gz
Windows二进制 fgnet_3.14.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) fgnet_3.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fgnet
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/fgnet
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/fgnet/
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