FunciSNP

DOI:10.18129 / B9.bioc.FunciSNP

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见FunciSNP．

整合功能性非编码数据集与遗传关联研究以识别候选调控snp

Bioconductor版本:3.7

FunciSNP整合了来自GWAS、1000个基因组和染色质特征的信息，以识别编码或非编码区域的功能性SNP。

作者:Simon G. Coetzee < Simon at simoncoetzee.com>和Houtan Noushmehr，博士< Houtan at usp.br>

维护者:Simon G. Coetzee < Simon at simoncoetzee.com>

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文本		新闻

细节

biocViews	注释，DataImport，DataRepresentation，基础设施，SequenceMatching，软件
版本	1.24.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(6年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.14.0)，ggplot2，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，FunciSNP.data
进口	方法,BiocGenerics，Biobase，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，Rsamtools(> = 1.6.1),rtracklayer(> = 1.14.1),ChIPpeakAnno(> = 2.2.0),VariantAnnotation，plyr，snpStats，ggplot2(> = 0.9.0),重塑(> = 0.8.4),尺度
链接
建议	org.Hs.eg.db
SystemRequirements
增强了	平行
URL	http://coetzeeseq.usc.edu/publication/Coetzee_SG_et_al_2012/
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	FunciSNP_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	FunciSNP_1.24.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	FunciSNP_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FunciSNP
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/FunciSNP
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/FunciSNP/
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