GOstats

DOI:10.18129 / B9.bioc.GOstats

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GOstats

去微阵列的操作工具

Bioconductor版本:3.7

相互作用的一组工具和微阵列数据。各种基本操作工具图,假设检验和其他简单的计算。

作者:罗伯特先生(aut),赛斯猎鹰(施),罗伯特·Castelo[所有],Bioconductor包维护者(cre)

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

从内部引用(R,回车引用(“GOstats”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“GOstats”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GOstats”)

PDF R脚本 超几何测试不太常见的生物模型
PDF R脚本 使用GOstats超几何测试
PDF R脚本 使用GOstats可视化数据
PDF 参考手册

细节

biocViews 注释,,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,微阵列,MultipleComparison,通路,软件
版本 2.46.0
Bioconductor自 BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 13.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.10),Biobase(> = 1.15.29),类别(> = 2.43.2),
进口 方法、统计stats4,AnnotationDbi(> = 0.0.89),GO.db(> = 1.13.0),RBGL,注释(> = 1.13.2),AnnotationForge,Rgraphviz
链接
建议 hgu95av2.db(> = 1.13.0),所有,,genefilter,RColorBrewer,xtable,SparseM,GSEABase,geneplotter,org.Hs.eg.db,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 MineICA,RDAVIDWebService
进口我 affycoretools,吸引,categoryCompare,facopy,理想的,MAGeCKFlute,MIGSA,pcaExplorer,ProCoNA,ReportingTools,systemPipeR
建议我 BiocCaseStudies,类别,eisa,fastLiquidAssociation,GSEAlm,HTSanalyzeR,interactiveDisplay,MineICA,miRLAB,中长期规划,MmPalateMiRNA,phenoDist,qpgraph,RnBeads,安全
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包 GOstats_2.46.0.tar.gz
Windows二进制 GOstats_2.46.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) GOstats_2.46.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOstats
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GOstats
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/GOstats/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置: