GoogleGenomics

DOI:10.18129 / B9.bioc.GoogleGenomics

这个包是3.7版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见GoogleGenomics．

R客户端b谷歌基因组API

Bioconductor版本:3.7

提供一个R包与谷歌Genomics API交互。

作者:卡西·多尔、妮可·德福

维护者:悉达多·巴格里亚<巴格里亚。悉达多在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("GoogleGenomics")

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“GoogleGenomics”)

超文本标记语言	R脚本	注释变体
超文本标记语言	R脚本	绘制平面图
超文本标记语言	R脚本	再现变体注释结果
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport，遗传学，软件，ThirdPartyClient
版本	2.2.0
在Bioconductor中	BioC 3.1 (R-3.2)(3.5年)
许可证	Apache License (== 2.0) | file License
取决于	R (>= 3.1.0)，GenomicAlignments(> = 1.0.1),VariantAnnotation
进口	Biostrings，GenomeInfoDb，GenomicRanges，IRanges，httr，rjson，Rsamtools，S4Vectors(> = 0.9.25),Biobase、方法、utils
链接
建议	BiocStyle，RProtoBuf，httpuv，knitr，rmarkdown，testthat，ggbio，ggplot2，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，org.Hs.eg.db，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL	https://cloud.google.com/genomics/
BugReports	https://github.com/Bioconductor/GoogleGenomics/issues
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	GoogleGenomics_2.2.0.tar.gz
Windows二进制	GoogleGenomics_2.2.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	GoogleGenomics_2.2.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/GoogleGenomics
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/GoogleGenomics
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GoogleGenomics/
软件包下载报告	下载数据