InteractionSet

DOI:10.18129 / B9.bioc.InteractionSet

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见InteractionSet。

用于存储基因组相互作用数据的基类

Bioconductor版本:3.7

提供GInteractions、InteractionSet和ContactMatrix对象和相关方法，用于存储和操作来自Hi-C和ChIA-PET实验的基因组相互作用数据。

作者:Aaron Lun ， Malcolm Perry ， Liz Ing-Simmons < Liz。Ing-simmons12在csc.mrc.ac.uk>

维护者:Aaron Lun

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“InteractionSet”)

文档

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browseVignettes(“InteractionSet”)

超文本标记语言	R脚本	与InteractionSet类交互以获得基因组相互作用数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation，嗝，基础设施，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.5)，GenomicRanges，SummarizedExperiment
进口	IRanges，S4Vectors(> = 0.17.21),GenomeInfoDb，BiocGenerics、方法、矩阵，Rcpp
链接	Rcpp
建议	testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
全靠我	diffHic，GenomicInteractions，MACPET，sevenC
进口我	HiCcompare，trackViewer
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	InteractionSet_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	InteractionSet_1.8.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	InteractionSet_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/InteractionSet
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/InteractionSet
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/InteractionSet/
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